1994年11月17日，原天津对外贸易学院并入南开大学,该校图书馆亦并入南开大学图书馆。1996年6月，迎水道校区图书馆合并到总馆，并更名为“南开大学图书馆迎水道校区分馆”。根据学校发展总体规划，2015年迎水道校区整体出让，迎水道校区图书馆结束使命。